大数据助力精准诊断——赛乐基因受邀参加2020长三角体外诊断产业高峰论坛

2020年12月01日
2020年11月25日至26日,2020长三角体外诊断高峰论坛在上海嘉定隆重召开。本次高峰论坛吸引了全国各地近500名业内人士参会,齐聚一堂,在思想的碰撞与融合中,共话体外诊断领域广阔的未来。
赛乐基因受邀参加本次论坛,并由公司生物信息总监葛平博士在“大数据助力精准诊断”专场做了题为“BaseNumber基因数据分析加速平台在精准医疗中的应用”的专题报告。
葛平博士介绍了赛乐基因基于CPU+GPU异构计算技术开发的BaseNumber基因数据分析分析加速平台的技术特点及优势,并针对肿瘤检测、遗传病检测等精准医疗领域生物信息分析”慢“且”贵“的问题,分享了赛乐基因为临床基因检测企业、医院精准医学中心等各种用户实际场景提供的生物信息分析加速解决方案。
BaseNumber平台对遗传病检测常用的胚系变异检测流程和肿瘤检测常用的体细胞变异检测流程都进行了提速。使用BaseNumber(4GPUs)对人类WGS(30X)和WES(200X)数据进行胚系变异分析分别只需12分钟和1.5分钟;对人类WES(800X)和大panel(8000X)数据进行体细胞变异分析分别只需6分40秒和4分钟。相比于普通CPU服务器运行GATK流程都有巨大计算效率提升。
赛乐基因对遗传病检测、产前、新生儿筛查等领域常用的胚系变异检测数据分析进行了提速,在不损失分析分析准确性的前提下,使用一台4显卡的GPU服务器对人类WGS(30X)和WES(200X)数据进行胚系变异分析分别只需12分钟和1.5分钟。赛乐基因还对肿瘤检测常用的体细胞变异检测流程进行了提速,使用一台4显卡的GPU服务器对人类WES(800X)和大panel(8000X)数据进行体细胞变异分析分别只需6分40秒和4分钟。在单节点基因数据分析性能方面,赛乐基因已经居全球领先水平。   BaseNumber极致的分析速度、超高的分析准确性、场景化的应用灵活性引发了与会专家的关注和热烈讨论。
赛乐基因,让基因大数据助力精准诊断。
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